مركز توسعه آموزش علوم پزشكي دانشگاه‌ علوم پزشكي لرستان در آغاز شامل پنج واحد يا دفتر اصلي شامل برنامه‌ريزي درسي، آموزش استادان، آموزش مداوم، ارزشيابي، و پژوهش در آموزش بوده است. اما طي چند سال پس از تأسيس به اقتضاي شرايط و نيازها و در نتيجه گسترش فعاليت‌ها، واحدهاي ديگري به ساختار سازماني اين مراكز اضافه گرديده است. لازم به ذكر است كه در برخي دانشگاه‌ها، به ويژه دانشگاه‌هاي بزرگ، اجراي برخي برنامه‌ها و فعاليت‌ها توسط دفاتر يا مراكز مستقل و موازي مراكز توسعه آموزش، تحت مديريت مستقيم معاونت هاي آموزشي صورت مي‌گيرد.